Пандемия COVID-19 стимулировала расшифровку геномов разных патогенов в Африке и Азии, где ряд стран закупили оборудование для секвенирования, которое позволяет прочитать геном (вируса, бактерии или еще какого-нибудь организма) и понять, кому он принадлежит. Теперь эту аппаратуру используют для выявления возбудителей холеры, туберкулеза, лихорадки денге и других болезней. Правда, одной техники недостаточно. Об этом пишет Nature.

Перед пандемией секвенирование проводили в основном для исследований, а теперь его используют еще и в здравоохранении. Полученные данные вместе с другой информацией помогают поставить диагноз, определить цепочку заражений, отследить мутации и вспышки болезней, ускорить ответные меры, разработать вакцины.

Когда появился коронавирус SARS-CoV-2, Институт Пастера в Камбодже получил деньги на покупку нескольких секвенаторов, в том числе переносных, серверов, компьютеров и более быстрое подключение к интернету. Расшифровка одного генома SARS-CoV-2 подешевела с $1 тыс. в начале 2020-го до $20 в конце 2021 года.

Новое оборудование также использовали во время недавних вспышек гриппа и лихорадки Чикунгунья, а также для проверки образцов с вирусами денге, летучих мышей и грызунов. Теперь ученые занялись метагеномными исследованиями: анализируют, что содержится в воздухе на рынках, где торгуют зверьем, скотобойнях и в пещерах с летучими мышами.

В Африке в 2018 году только в семи странах были секвенаторы следующего поколения. Теперь таких стран порядка 38. Модернизация началась еще до пандемии, но COVID-19 ускорил этот процесс. Когда в начале 2022 года на востоке ДР Конго выявили случай лихорадки Эбола, образцы, взятые у заболевшего, проверили в лаборатории в 240 км от его города. Раньше их пришлось бы везти в столицу, расположенную в 1,6 тыс. км. Ученые установили, что эта разновидность вируса уже встречалась, то есть новый межвидовой переход не состоялся.