В Индии ученые адаптировали геномный редактор CRISPR/Cas12 для создания экспресс-теста на вирус оспы обезьян, который позволяет выявить инфекцию с почти 100% точностью за несколько десятков минут после сбора биоматериала. Первые опыты описаны в препринте на medRxiv.

Еще год назад биологи из США приспособили геномный редактор CRISPR/Cas12 для поиска следов различных штаммов коронавируса в образцах слюны пациентов. Их индийские коллеги из Центра атомных исследований имени Хоми Баба в Тромбее под руководством Девашиша Ратаиспользовали эту вариацию редактора ДНК для создания экспресс-теста на следы присутствия в биообразцах частиц вируса MPXV, вызывающего вирусную оспу обезьян.

Для своей работы исследователи изучили и сравнили между собой структуру polA, ключевого гена вирусов оспы, который отвечает за подготовку новых копий ДНК этих патогенов. В результате этого исследователям удалось выделить небольшой участок в этом гене, уникальный для MPXV и обладающий иной структурой в геноме остальных представителей рода Orthopoxvirus.

После этого исследователи модифицировали РНК и белковые компоненты геномного редактора CRISPR/Cas12 таким образом, что они начали соединяться с этим участком гена polA и вырабатывать светящиеся молекулы. Работу этой системы биологи проверили на растворах, содержавших смесь из частиц MPXV, а также нескольких других вирусов оспы.

Эти опыты показали, что модифицированная версия CRISPR/Cas12 очень быстро фиксировала следы вируса в образцах даже в тех случаях, когда в них содержалось несколько десятков полных копий или обрывков генома MPXV. Это также происходило и при добавлении в раствор частиц вирусов оспы птиц и других представителей рода Orthopoxvirus, что делает данную систему особенно перспективной для выявления носителей вирусной оспы обезьян в регионах, где распространяются несколько разновидностей этих патогенов.