Ученые из Гарвардского университета в США и Университета Данкук в Южной Корее обнаружили несколько генетических разновидностей коронавируса SARS-CoV-2, вызывающего заболевание COVID-19. Эти разновидности отличаются друг от друга нуклеотидными последовательностями в РНК-геномах.
По словам ученых, пока неизвестно, связано ли это разнообразие вирусов с течением и исходом заболевания COVID-19 и может ли повлиять на разработку вакцины. Результаты исследования доступны в препринте, опубликованном в репозитории bioRxiv.
Как рассказывает Lenta.ru, вышеназванные ученые проанализировали одноцепочечные РНК-последовательности вирусов, выделенных у 11 132 пациентов с SARS-CoV-2 и хранящихся в базе данных GISAID, которая содержит информацию о полных или частично секвенированных геномах коронавируса. Они попарно сравнили 2540 нуклеотидных последовательностей, определяя нуклеотидные замены — точечные мутации, при которых один нуклеотид РНК-последовательности заменяется на другой. Таким образом ученым удалось измерить уровень сходства между различными геномами SARS-CoV-2, взятыми у пациентов со всего мира.
В ходе исследования ученым удалось выявить 4 обособленные ветви (кластера) среди европейских и североамериканских образцов коронавируса. 2 из них преимущественно европейские, одна характерна для США, а последняя представляет собой смесь вирусов США и Европы. Интересно, что только одна преимущественно европейская ветвь непосредственно связана с вирусами из Китая. Последние образуют кластер «оригинальных» вирусов, которые попали в Европу и США из Азии. Еще одна ветвь содержит геномы из Европы, Японии, Австралии и Новой Зеландии.
Таким образом, ученые выяснили, что геномы коронавируса варьируются в зависимости от региона, и существуют различия между вирусами из Азии и из западных стран.
Скорее всего, изначально генетический состав SARS-CoV-2 был более однородным, однако затем появились разные ветви. Распространение вируса по миру привело к большему разнообразию геномов. Результаты анализа соответствуют картине развития пандемии, заключают авторы исследования. По их мнению, усилия по разработке вакцины должны учитывать генетическую изменчивость возбудителя COVID-19.
Следите за NEWS.am Medicine на Facebook и Twitter